移动支付在带来便捷的同时，其安全性也备受关注。因为一旦用于支付的手机丢失，会给使用者带来很大的麻烦，比如需要尽快修改登陆密码、账号密码、支付密码等，不但需要花费大量时间，一旦出现密码泄漏就很可能给自己带来严重的经济损失。面对这一问题，生物识别技术成为了救世主。

基于生物识别的支付方式主要利用人体的固有生物特征，如指纹、人脸等，来进行身份的鉴别。与传统的移动支付方式相比，生物识别技术具有高安全性、随身性、唯一性和便捷性等优势，能够解决目前移动支付中存在的风险。生物识别技术最早出现于2014年，瑞典初创公司推出了手掌支付功能。同年，支付宝联合三星推出了指纹支付方式，并在支付宝钱包以及三星S5上应用。2015年，阿里巴巴又推出了“刷脸支付”的方式，引起了极大的轰动。2016年蚂蚁金服将刷脸支付功能进一步完善，并亮相西湖文化广场。

随着生物识别技术的风靡，包括虹膜识别、静脉识别、脑纹识别等众多识别技术开始出现，纷纷进军移动支付领域，在提供多重保障的同时，也促进了人机沟通的加强。